XML išlieka sveikatos priežiūros duomenų mainų akmuo, stiprina HL7 pranešimus, įmonių integracijos variklius ir paveldimos ligoninės informacijos sistemas. DICOM metaduomenų konvertavimas į XML leidžia nesąžiningą integraciją tarp medicinos vaizdavimo sistemų ir platesnės sveikatos IT infrastruktūros. Šis vadovas parodo, kaip konvertuoti DIKOM XML naudojant Aspose.Medical .NET.
Kodėl XML sveikatos priežiūros integracijai?
Nors JSON dominuoja šiuolaikines žiniatinklio API, XML ir toliau yra būtina sveikatos priežiūros srityje dėl kelių priežasčių:
- HL7 standartai: HL7 v2 ir v3 pranešimai plačiai naudoja XML pagrįstus formatus
- Verslo integracija: Daugelis sveikatos priežiūros integracijos variklių (Mirth Connect, Rhapsody) daugiausia dirba su XML
- Legacy sistemos: įsteigtos ligoninės informacinės sistemos dažnai reikalauja XML duomenų šaltinių
- Dokumentų standartai: CDA (Clinical Document Architecture) ir kiti klinikiniai dokumentai naudoja XML
- Validacija: XML schema (XSD) suteikia tvirtas duomenų validavimo galimybes
Pagrindinis DICOM į XML konvertavimas
Paprasčiausias konvertavimas iš DICOM į XML:
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;
public class DicomXmlConverter
{
public string ConvertToXml(string dicomFilePath)
{
// Load DICOM file
DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(dicomFilePath);
// Serialize to XML string
string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(dicomFile.Dataset);
return xml;
}
public void ConvertToXmlFile(string dicomFilePath, string outputXmlPath)
{
DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(dicomFilePath);
using (var stream = new FileStream(outputXmlPath, FileMode.Create))
{
DicomXmlSerializer.Serialize(stream, dicomFile.Dataset);
}
}
}
Formatuotas XML išleidimas
Žmogaus skaitymo produkcija ir debugavimas:
public string ConvertToFormattedXml(string dicomFilePath)
{
DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(dicomFilePath);
var options = new DicomXmlSerializerOptions
{
WriteIndented = true // Pretty-print XML
};
string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(dicomFile.Dataset, options);
return xml;
}
Konvertavimas: XML į DICOM
Konvertuokite XML atgal į DICOM dvišaliems darbo srautams:
public class DicomXmlRoundTrip
{
public void XmlToDicom(string xmlFilePath, string outputDicomPath)
{
// Read XML content
string xml = File.ReadAllText(xmlFilePath);
// Deserialize to DICOM dataset
DicomDataset dataset = DicomXmlSerializer.Deserialize(xml);
// Create DICOM file and save
DicomFile dicomFile = new DicomFile(dataset);
dicomFile.Save(outputDicomPath);
}
public DicomDataset XmlStringToDataset(string xml)
{
return DicomXmlSerializer.Deserialize(xml);
}
public void ValidateRoundTrip(string originalDicomPath)
{
// Load original
DicomFile original = DicomFile.Open(originalDicomPath);
// Convert to XML
string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(original.Dataset);
// Convert back to DICOM
DicomDataset restored = DicomXmlSerializer.Deserialize(xml);
// Compare key fields
string originalPatientName = original.Dataset.GetString(DicomTag.PatientName);
string restoredPatientName = restored.GetString(DicomTag.PatientName);
Console.WriteLine($"Original Patient Name: {originalPatientName}");
Console.WriteLine($"Restored Patient Name: {restoredPatientName}");
Console.WriteLine($"Match: {originalPatientName == restoredPatientName}");
}
}
HL7 integracijos tiltas
Sukurkite paslaugą, kuri konvertuoja DICOM metaduomenis į HL7 suderinamą XML:
using System.Xml.Linq;
public class DicomHl7Bridge
{
public string ConvertToHl7CompatibleXml(string dicomFilePath)
{
DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(dicomFilePath);
var dataset = dicomFile.Dataset;
// Create HL7-style XML structure
var hl7Message = new XElement("ORU_R01",
new XAttribute("xmlns", "urn:hl7-org:v2xml"),
// Message Header
new XElement("MSH",
new XElement("MSH.1", "|"),
new XElement("MSH.2", "^~\\&"),
new XElement("MSH.3", "PACS"),
new XElement("MSH.4", dataset.GetString(DicomTag.InstitutionName) ?? ""),
new XElement("MSH.7", DateTime.Now.ToString("yyyyMMddHHmmss")),
new XElement("MSH.9",
new XElement("MSG.1", "ORU"),
new XElement("MSG.2", "R01")),
new XElement("MSH.10", Guid.NewGuid().ToString()),
new XElement("MSH.11", "P"),
new XElement("MSH.12", "2.5.1")
),
// Patient Identification
new XElement("PID",
new XElement("PID.3",
new XElement("CX.1", dataset.GetString(DicomTag.PatientID) ?? "")),
new XElement("PID.5",
new XElement("XPN.1", dataset.GetString(DicomTag.PatientName) ?? "")),
new XElement("PID.7", dataset.GetString(DicomTag.PatientBirthDate) ?? ""),
new XElement("PID.8", dataset.GetString(DicomTag.PatientSex) ?? "")
),
// Order Information
new XElement("OBR",
new XElement("OBR.2", dataset.GetString(DicomTag.AccessionNumber) ?? ""),
new XElement("OBR.4",
new XElement("CE.1", dataset.GetString(DicomTag.Modality) ?? ""),
new XElement("CE.2", dataset.GetString(DicomTag.StudyDescription) ?? "")),
new XElement("OBR.7", dataset.GetString(DicomTag.StudyDate) ?? ""),
new XElement("OBR.24", "RAD")
),
// Observation with DICOM reference
new XElement("OBX",
new XElement("OBX.2", "RP"),
new XElement("OBX.3",
new XElement("CE.1", "DICOM"),
new XElement("CE.2", "DICOM Study")),
new XElement("OBX.5", dataset.GetString(DicomTag.StudyInstanceUID) ?? ""),
new XElement("OBX.11", "F")
)
);
return hl7Message.ToString();
}
}
Integracija su sveikatos priežiūros tarpininkyste
Sukurkite verslo integracijos variklius:
public class HealthcareIntegrationService
{
private readonly string _outputDirectory;
private readonly ILogger _logger;
public HealthcareIntegrationService(string outputDirectory, ILogger logger)
{
_outputDirectory = outputDirectory;
_logger = logger;
}
public async Task ProcessDicomForIntegration(string dicomFilePath)
{
try
{
DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(dicomFilePath);
var dataset = dicomFile.Dataset;
string accessionNumber = dataset.GetString(DicomTag.AccessionNumber) ??
Guid.NewGuid().ToString();
// Generate standard DICOM XML
string dicomXml = DicomXmlSerializer.Serialize(dataset,
new DicomXmlSerializerOptions { WriteIndented = true });
// Save DICOM XML
string dicomXmlPath = Path.Combine(_outputDirectory, $"{accessionNumber}_dicom.xml");
await File.WriteAllTextAsync(dicomXmlPath, dicomXml);
// Generate HL7 bridge XML
var bridge = new DicomHl7Bridge();
string hl7Xml = bridge.ConvertToHl7CompatibleXml(dicomFilePath);
string hl7XmlPath = Path.Combine(_outputDirectory, $"{accessionNumber}_hl7.xml");
await File.WriteAllTextAsync(hl7XmlPath, hl7Xml);
// Generate metadata summary for quick lookup
var summary = GenerateMetadataSummary(dataset, accessionNumber);
string summaryPath = Path.Combine(_outputDirectory, $"{accessionNumber}_summary.xml");
await File.WriteAllTextAsync(summaryPath, summary);
_logger.LogInformation($"Processed DICOM file: {accessionNumber}");
}
catch (Exception ex)
{
_logger.LogError($"Failed to process {dicomFilePath}: {ex.Message}");
throw;
}
}
private string GenerateMetadataSummary(DicomDataset dataset, string accessionNumber)
{
var summary = new XElement("DicomMetadataSummary",
new XAttribute("timestamp", DateTime.UtcNow.ToString("O")),
new XElement("Identifiers",
new XElement("AccessionNumber", accessionNumber),
new XElement("StudyInstanceUID", dataset.GetString(DicomTag.StudyInstanceUID)),
new XElement("SeriesInstanceUID", dataset.GetString(DicomTag.SeriesInstanceUID)),
new XElement("SOPInstanceUID", dataset.GetString(DicomTag.SOPInstanceUID))
),
new XElement("Patient",
new XElement("ID", dataset.GetString(DicomTag.PatientID)),
new XElement("Name", dataset.GetString(DicomTag.PatientName)),
new XElement("BirthDate", dataset.GetString(DicomTag.PatientBirthDate)),
new XElement("Sex", dataset.GetString(DicomTag.PatientSex))
),
new XElement("Study",
new XElement("Date", dataset.GetString(DicomTag.StudyDate)),
new XElement("Time", dataset.GetString(DicomTag.StudyTime)),
new XElement("Description", dataset.GetString(DicomTag.StudyDescription)),
new XElement("ReferringPhysician", dataset.GetString(DicomTag.ReferringPhysicianName))
),
new XElement("Series",
new XElement("Modality", dataset.GetString(DicomTag.Modality)),
new XElement("Description", dataset.GetString(DicomTag.SeriesDescription)),
new XElement("BodyPart", dataset.GetString(DicomTag.BodyPartExamined))
),
new XElement("Equipment",
new XElement("Manufacturer", dataset.GetString(DicomTag.Manufacturer)),
new XElement("Model", dataset.GetString(DicomTag.ManufacturerModelName)),
new XElement("StationName", dataset.GetString(DicomTag.StationName)),
new XElement("Institution", dataset.GetString(DicomTag.InstitutionName))
)
);
return summary.ToString();
}
}
„Batch“ apdorojimas įmonių migracijai
Apdoroti didelio masto DICOM į XML konvertavimą sistemos migracijoms:
public class EnterpriseMigrationService
{
public async Task MigrateDicomArchiveToXml(
string sourceDirectory,
string targetDirectory,
int maxParallelism = 4)
{
Directory.CreateDirectory(targetDirectory);
var dicomFiles = Directory.GetFiles(sourceDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
var semaphore = new SemaphoreSlim(maxParallelism);
var tasks = new List<Task>();
var progress = 0;
var total = dicomFiles.Length;
foreach (var filePath in dicomFiles)
{
await semaphore.WaitAsync();
tasks.Add(Task.Run(async () =>
{
try
{
await ConvertSingleFile(filePath, sourceDirectory, targetDirectory);
var current = Interlocked.Increment(ref progress);
if (current % 100 == 0)
{
Console.WriteLine($"Progress: {current}/{total} files processed");
}
}
finally
{
semaphore.Release();
}
}));
}
await Task.WhenAll(tasks);
Console.WriteLine($"Migration complete: {total} files processed");
}
private async Task ConvertSingleFile(
string sourcePath,
string sourceRoot,
string targetRoot)
{
try
{
DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(sourcePath);
// Preserve directory structure
string relativePath = Path.GetRelativePath(sourceRoot, sourcePath);
string targetPath = Path.Combine(targetRoot,
Path.ChangeExtension(relativePath, ".xml"));
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(targetPath));
var options = new DicomXmlSerializerOptions { WriteIndented = true };
using (var stream = new FileStream(targetPath, FileMode.Create))
{
DicomXmlSerializer.Serialize(stream, dicomFile.Dataset, options);
}
}
catch (Exception ex)
{
// Log error but continue processing
await File.AppendAllTextAsync(
Path.Combine(targetRoot, "errors.log"),
$"{DateTime.Now}: {sourcePath} - {ex.Message}\n");
}
}
}
ASP.NET Core API XML konvertavimui
Sukurkite žiniatinklio galutinius taškus paklausos konvertavimui:
[ApiController]
[Route("api/[controller]")]
public class DicomXmlController : ControllerBase
{
[HttpPost("convert")]
[Produces("application/xml")]
public async Task<IActionResult> ConvertToXml(IFormFile file)
{
if (file == null || file.Length == 0)
{
return BadRequest("No DICOM file provided");
}
var tempPath = Path.GetTempFileName();
try
{
using (var stream = new FileStream(tempPath, FileMode.Create))
{
await file.CopyToAsync(stream);
}
DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(tempPath);
var options = new DicomXmlSerializerOptions { WriteIndented = true };
string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(dicomFile.Dataset, options);
return Content(xml, "application/xml");
}
finally
{
System.IO.File.Delete(tempPath);
}
}
[HttpPost("to-hl7")]
[Produces("application/xml")]
public async Task<IActionResult> ConvertToHl7(IFormFile file)
{
if (file == null || file.Length == 0)
{
return BadRequest("No DICOM file provided");
}
var tempPath = Path.GetTempFileName();
try
{
using (var stream = new FileStream(tempPath, FileMode.Create))
{
await file.CopyToAsync(stream);
}
var bridge = new DicomHl7Bridge();
string hl7Xml = bridge.ConvertToHl7CompatibleXml(tempPath);
return Content(hl7Xml, "application/xml");
}
finally
{
System.IO.File.Delete(tempPath);
}
}
[HttpPost("from-xml")]
public async Task<IActionResult> ConvertFromXml()
{
using var reader = new StreamReader(Request.Body);
string xml = await reader.ReadToEndAsync();
try
{
DicomDataset dataset = DicomXmlSerializer.Deserialize(xml);
DicomFile dicomFile = new DicomFile(dataset);
var memoryStream = new MemoryStream();
dicomFile.Save(memoryStream);
memoryStream.Position = 0;
return File(memoryStream, "application/dicom", "converted.dcm");
}
catch (Exception ex)
{
return BadRequest($"Invalid XML: {ex.Message}");
}
}
}
XML patvirtinimas su schema
Konvertuoto XML patvirtinimas prieš pritaikytą schemą:
using System.Xml;
using System.Xml.Schema;
public class DicomXmlValidator
{
private readonly XmlSchemaSet _schemaSet;
private readonly List<string> _validationErrors;
public DicomXmlValidator(string schemaPath)
{
_schemaSet = new XmlSchemaSet();
_schemaSet.Add(null, schemaPath);
_validationErrors = new List<string>();
}
public bool ValidateXml(string xml, out List<string> errors)
{
_validationErrors.Clear();
var settings = new XmlReaderSettings
{
ValidationType = ValidationType.Schema,
Schemas = _schemaSet
};
settings.ValidationEventHandler += (sender, e) =>
{
_validationErrors.Add($"{e.Severity}: {e.Message}");
};
try
{
using (var stringReader = new StringReader(xml))
using (var xmlReader = XmlReader.Create(stringReader, settings))
{
while (xmlReader.Read()) { }
}
}
catch (XmlException ex)
{
_validationErrors.Add($"XML Error: {ex.Message}");
}
errors = new List<string>(_validationErrors);
return errors.Count == 0;
}
}
Geriausios praktikos
Konvertuojant DICOM į XML sveikatos priežiūros integracijai:
- Išsaugokite kodavimą: Įsitikinkite, kad charakterio kodavimas tvarkomas teisingai, ypač tarptautiniams pacientų vardams
- Binarių duomenų tvarkymas: dideli pikselių duomenys turėtų būti nukreipti išorės, o ne įterpti į XML
- Validuokite rezultatus: Naudokite XML schemos validavimą kritiniams integracijos taškams
- Apsvarstymas: dideliems archyvams naudokite srauto serializavimą ir lygiagrečią apdorojimą
- Dokumentų žemėlapiai: Saugokite aiškią dokumentą apie tai, kaip DICOM pažymėjo jūsų XML struktūrą
Conclusion
Konvertavimas DICOM failus į XML leidžia integraciją su verslo sveikatos priežiūros sistemų, HL7 žinutės, ir paveldėjimo programų. Aspose.Medical for .NET suteikia tvirtas serializavimo pajėgumus su palaikymu apvalios kelionės konvertavimo, užtikrinant duomenų vientisumą per formatų transformacijas. Nesvarbu, ar jūs statyti integracijos tiltus, migracijos duomenis, arba prisijungti prie ligoninės informacinės sistemos, šie XML konversijos metodai teikia tvirą pagrindą sveikatingumo sąveikos.
Norėdami gauti daugiau informacijos apie DICOM XML serializavimą, apsilankykite Aspose.Medicininė dokumentacija.
More in this category
- DICOM duomenų rinkinys AI ir mašinų mokymui su Aspose.Medical
- Kodėl DICOM anonimiškumas svarbus HIPAA ir GDPR .NET darbo srautams
- Pritaikyti konfidencialumo profiliai, pritaikantys DICOM anonimiškumą jūsų ligoninės politikai
- Sukurti DICOM anonimizacijos Microservice ASP.NET Core
- DICOM metaduomenų saugojimas SQL ir NoSQL duomenų bazėse C#