XML sağlık veri değişimi, güçlendirme HL7 mesajlaşma, kurumsal entegrasyon motorları ve kalıtsal hastane bilgi sistemleri bir köşedir. DICOM metadata dönüştürme XML tıbbi görüntü sistemi ve daha geniş sağlık BT altyapısı arasındaki anahtar bir entegre olmasını sağlar. Bu rehber Aspose.Medical .NET kullanılarak DIKOM’u XML’e nasıl dönüştüreceğini gösterir.

Sağlık Hizmetleri için XML Neden?

JSON modern web APIs’leri domine ederken, XML çeşitli nedenlerden dolayı sağlık alanında önemli olmaya devam ediyor:

  • HL7 standartları: HL7 v2 ve v3 mesajları XML tabanlı biçimleri geniş bir şekilde kullanır
  • Enterprise Integration: Birçok sağlık entegrasyon motoru (Mirth Connect, Rhapsody) öncelikle XML ile çalışır
  • Legacy sistemleri: Yerleşik hastane bilgilendirme sistemi genellikle XML veri kaynağı gerektirir
  • Doküman Standartları: CDA (Clinical Document Architecture) ve diğer klinik belgeler XML kullanır
  • Validasyon: XML Şeması (XSD) sağlam veri validasyon kapasiteleri sağlar

Temel DICOM XML dönüştürme

DICOM’dan XML’e en basit dönüşüm:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

public class DicomXmlConverter
{
    public string ConvertToXml(string dicomFilePath)
    {
        // Load DICOM file
        DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(dicomFilePath);
        
        // Serialize to XML string
        string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(dicomFile.Dataset);
        
        return xml;
    }
    
    public void ConvertToXmlFile(string dicomFilePath, string outputXmlPath)
    {
        DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(dicomFilePath);
        
        using (var stream = new FileStream(outputXmlPath, FileMode.Create))
        {
            DicomXmlSerializer.Serialize(stream, dicomFile.Dataset);
        }
    }
}

Formatlı XML Çıkış

İnsan okunabilir üretimi ve debugging için:

public string ConvertToFormattedXml(string dicomFilePath)
{
    DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(dicomFilePath);
    
    var options = new DicomXmlSerializerOptions
    {
        WriteIndented = true  // Pretty-print XML
    };
    
    string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(dicomFile.Dataset, options);
    
    return xml;
}

Round-Trip Dönüşüm: XML ile DICOM

İki yönlü çalışma akışları için XML’i DICOM’a dönüştürün:

public class DicomXmlRoundTrip
{
    public void XmlToDicom(string xmlFilePath, string outputDicomPath)
    {
        // Read XML content
        string xml = File.ReadAllText(xmlFilePath);
        
        // Deserialize to DICOM dataset
        DicomDataset dataset = DicomXmlSerializer.Deserialize(xml);
        
        // Create DICOM file and save
        DicomFile dicomFile = new DicomFile(dataset);
        dicomFile.Save(outputDicomPath);
    }
    
    public DicomDataset XmlStringToDataset(string xml)
    {
        return DicomXmlSerializer.Deserialize(xml);
    }
    
    public void ValidateRoundTrip(string originalDicomPath)
    {
        // Load original
        DicomFile original = DicomFile.Open(originalDicomPath);
        
        // Convert to XML
        string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(original.Dataset);
        
        // Convert back to DICOM
        DicomDataset restored = DicomXmlSerializer.Deserialize(xml);
        
        // Compare key fields
        string originalPatientName = original.Dataset.GetString(DicomTag.PatientName);
        string restoredPatientName = restored.GetString(DicomTag.PatientName);
        
        Console.WriteLine($"Original Patient Name: {originalPatientName}");
        Console.WriteLine($"Restored Patient Name: {restoredPatientName}");
        Console.WriteLine($"Match: {originalPatientName == restoredPatientName}");
    }
}

HL7 Entegre Köprüsü

DICOM metadata HL7 uyumlu XML’e dönüştüren bir hizmet oluşturun:

using System.Xml.Linq;

public class DicomHl7Bridge
{
    public string ConvertToHl7CompatibleXml(string dicomFilePath)
    {
        DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(dicomFilePath);
        var dataset = dicomFile.Dataset;
        
        // Create HL7-style XML structure
        var hl7Message = new XElement("ORU_R01",
            new XAttribute("xmlns", "urn:hl7-org:v2xml"),
            
            // Message Header
            new XElement("MSH",
                new XElement("MSH.1", "|"),
                new XElement("MSH.2", "^~\\&"),
                new XElement("MSH.3", "PACS"),
                new XElement("MSH.4", dataset.GetString(DicomTag.InstitutionName) ?? ""),
                new XElement("MSH.7", DateTime.Now.ToString("yyyyMMddHHmmss")),
                new XElement("MSH.9",
                    new XElement("MSG.1", "ORU"),
                    new XElement("MSG.2", "R01")),
                new XElement("MSH.10", Guid.NewGuid().ToString()),
                new XElement("MSH.11", "P"),
                new XElement("MSH.12", "2.5.1")
            ),
            
            // Patient Identification
            new XElement("PID",
                new XElement("PID.3",
                    new XElement("CX.1", dataset.GetString(DicomTag.PatientID) ?? "")),
                new XElement("PID.5",
                    new XElement("XPN.1", dataset.GetString(DicomTag.PatientName) ?? "")),
                new XElement("PID.7", dataset.GetString(DicomTag.PatientBirthDate) ?? ""),
                new XElement("PID.8", dataset.GetString(DicomTag.PatientSex) ?? "")
            ),
            
            // Order Information
            new XElement("OBR",
                new XElement("OBR.2", dataset.GetString(DicomTag.AccessionNumber) ?? ""),
                new XElement("OBR.4",
                    new XElement("CE.1", dataset.GetString(DicomTag.Modality) ?? ""),
                    new XElement("CE.2", dataset.GetString(DicomTag.StudyDescription) ?? "")),
                new XElement("OBR.7", dataset.GetString(DicomTag.StudyDate) ?? ""),
                new XElement("OBR.24", "RAD")
            ),
            
            // Observation with DICOM reference
            new XElement("OBX",
                new XElement("OBX.2", "RP"),
                new XElement("OBX.3",
                    new XElement("CE.1", "DICOM"),
                    new XElement("CE.2", "DICOM Study")),
                new XElement("OBX.5", dataset.GetString(DicomTag.StudyInstanceUID) ?? ""),
                new XElement("OBX.11", "F")
            )
        );
        
        return hl7Message.ToString();
    }
}

Sağlık Medyası ile Entegrasyon

İşletme entegrasyon motorları için bir hizmet oluşturun:

public class HealthcareIntegrationService
{
    private readonly string _outputDirectory;
    private readonly ILogger _logger;

    public HealthcareIntegrationService(string outputDirectory, ILogger logger)
    {
        _outputDirectory = outputDirectory;
        _logger = logger;
    }

    public async Task ProcessDicomForIntegration(string dicomFilePath)
    {
        try
        {
            DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(dicomFilePath);
            var dataset = dicomFile.Dataset;
            
            string accessionNumber = dataset.GetString(DicomTag.AccessionNumber) ?? 
                                     Guid.NewGuid().ToString();
            
            // Generate standard DICOM XML
            string dicomXml = DicomXmlSerializer.Serialize(dataset, 
                new DicomXmlSerializerOptions { WriteIndented = true });
            
            // Save DICOM XML
            string dicomXmlPath = Path.Combine(_outputDirectory, $"{accessionNumber}_dicom.xml");
            await File.WriteAllTextAsync(dicomXmlPath, dicomXml);
            
            // Generate HL7 bridge XML
            var bridge = new DicomHl7Bridge();
            string hl7Xml = bridge.ConvertToHl7CompatibleXml(dicomFilePath);
            
            string hl7XmlPath = Path.Combine(_outputDirectory, $"{accessionNumber}_hl7.xml");
            await File.WriteAllTextAsync(hl7XmlPath, hl7Xml);
            
            // Generate metadata summary for quick lookup
            var summary = GenerateMetadataSummary(dataset, accessionNumber);
            string summaryPath = Path.Combine(_outputDirectory, $"{accessionNumber}_summary.xml");
            await File.WriteAllTextAsync(summaryPath, summary);
            
            _logger.LogInformation($"Processed DICOM file: {accessionNumber}");
        }
        catch (Exception ex)
        {
            _logger.LogError($"Failed to process {dicomFilePath}: {ex.Message}");
            throw;
        }
    }

    private string GenerateMetadataSummary(DicomDataset dataset, string accessionNumber)
    {
        var summary = new XElement("DicomMetadataSummary",
            new XAttribute("timestamp", DateTime.UtcNow.ToString("O")),
            
            new XElement("Identifiers",
                new XElement("AccessionNumber", accessionNumber),
                new XElement("StudyInstanceUID", dataset.GetString(DicomTag.StudyInstanceUID)),
                new XElement("SeriesInstanceUID", dataset.GetString(DicomTag.SeriesInstanceUID)),
                new XElement("SOPInstanceUID", dataset.GetString(DicomTag.SOPInstanceUID))
            ),
            
            new XElement("Patient",
                new XElement("ID", dataset.GetString(DicomTag.PatientID)),
                new XElement("Name", dataset.GetString(DicomTag.PatientName)),
                new XElement("BirthDate", dataset.GetString(DicomTag.PatientBirthDate)),
                new XElement("Sex", dataset.GetString(DicomTag.PatientSex))
            ),
            
            new XElement("Study",
                new XElement("Date", dataset.GetString(DicomTag.StudyDate)),
                new XElement("Time", dataset.GetString(DicomTag.StudyTime)),
                new XElement("Description", dataset.GetString(DicomTag.StudyDescription)),
                new XElement("ReferringPhysician", dataset.GetString(DicomTag.ReferringPhysicianName))
            ),
            
            new XElement("Series",
                new XElement("Modality", dataset.GetString(DicomTag.Modality)),
                new XElement("Description", dataset.GetString(DicomTag.SeriesDescription)),
                new XElement("BodyPart", dataset.GetString(DicomTag.BodyPartExamined))
            ),
            
            new XElement("Equipment",
                new XElement("Manufacturer", dataset.GetString(DicomTag.Manufacturer)),
                new XElement("Model", dataset.GetString(DicomTag.ManufacturerModelName)),
                new XElement("StationName", dataset.GetString(DicomTag.StationName)),
                new XElement("Institution", dataset.GetString(DicomTag.InstitutionName))
            )
        );
        
        return summary.ToString();
    }
}

Enterprise Migration için Batch İşleme

Sistem göçleri için büyük ölçekli DICOM’u XML’e dönüştürün:

public class EnterpriseMigrationService
{
    public async Task MigrateDicomArchiveToXml(
        string sourceDirectory,
        string targetDirectory,
        int maxParallelism = 4)
    {
        Directory.CreateDirectory(targetDirectory);
        
        var dicomFiles = Directory.GetFiles(sourceDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
        
        var semaphore = new SemaphoreSlim(maxParallelism);
        var tasks = new List<Task>();
        var progress = 0;
        var total = dicomFiles.Length;

        foreach (var filePath in dicomFiles)
        {
            await semaphore.WaitAsync();
            
            tasks.Add(Task.Run(async () =>
            {
                try
                {
                    await ConvertSingleFile(filePath, sourceDirectory, targetDirectory);
                    
                    var current = Interlocked.Increment(ref progress);
                    if (current % 100 == 0)
                    {
                        Console.WriteLine($"Progress: {current}/{total} files processed");
                    }
                }
                finally
                {
                    semaphore.Release();
                }
            }));
        }

        await Task.WhenAll(tasks);
        
        Console.WriteLine($"Migration complete: {total} files processed");
    }

    private async Task ConvertSingleFile(
        string sourcePath, 
        string sourceRoot, 
        string targetRoot)
    {
        try
        {
            DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(sourcePath);
            
            // Preserve directory structure
            string relativePath = Path.GetRelativePath(sourceRoot, sourcePath);
            string targetPath = Path.Combine(targetRoot, 
                Path.ChangeExtension(relativePath, ".xml"));
            
            Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(targetPath));
            
            var options = new DicomXmlSerializerOptions { WriteIndented = true };
            
            using (var stream = new FileStream(targetPath, FileMode.Create))
            {
                DicomXmlSerializer.Serialize(stream, dicomFile.Dataset, options);
            }
        }
        catch (Exception ex)
        {
            // Log error but continue processing
            await File.AppendAllTextAsync(
                Path.Combine(targetRoot, "errors.log"),
                $"{DateTime.Now}: {sourcePath} - {ex.Message}\n");
        }
    }
}

ASP.NET Core API XML Dönüşüm için

On-demand dönüşüm için web endpoints oluşturun:

[ApiController]
[Route("api/[controller]")]
public class DicomXmlController : ControllerBase
{
    [HttpPost("convert")]
    [Produces("application/xml")]
    public async Task<IActionResult> ConvertToXml(IFormFile file)
    {
        if (file == null || file.Length == 0)
        {
            return BadRequest("No DICOM file provided");
        }

        var tempPath = Path.GetTempFileName();
        try
        {
            using (var stream = new FileStream(tempPath, FileMode.Create))
            {
                await file.CopyToAsync(stream);
            }

            DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(tempPath);
            
            var options = new DicomXmlSerializerOptions { WriteIndented = true };
            string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(dicomFile.Dataset, options);

            return Content(xml, "application/xml");
        }
        finally
        {
            System.IO.File.Delete(tempPath);
        }
    }

    [HttpPost("to-hl7")]
    [Produces("application/xml")]
    public async Task<IActionResult> ConvertToHl7(IFormFile file)
    {
        if (file == null || file.Length == 0)
        {
            return BadRequest("No DICOM file provided");
        }

        var tempPath = Path.GetTempFileName();
        try
        {
            using (var stream = new FileStream(tempPath, FileMode.Create))
            {
                await file.CopyToAsync(stream);
            }

            var bridge = new DicomHl7Bridge();
            string hl7Xml = bridge.ConvertToHl7CompatibleXml(tempPath);

            return Content(hl7Xml, "application/xml");
        }
        finally
        {
            System.IO.File.Delete(tempPath);
        }
    }

    [HttpPost("from-xml")]
    public async Task<IActionResult> ConvertFromXml()
    {
        using var reader = new StreamReader(Request.Body);
        string xml = await reader.ReadToEndAsync();

        try
        {
            DicomDataset dataset = DicomXmlSerializer.Deserialize(xml);
            DicomFile dicomFile = new DicomFile(dataset);

            var memoryStream = new MemoryStream();
            dicomFile.Save(memoryStream);
            memoryStream.Position = 0;

            return File(memoryStream, "application/dicom", "converted.dcm");
        }
        catch (Exception ex)
        {
            return BadRequest($"Invalid XML: {ex.Message}");
        }
    }
}

XML Validasyon Şeması

Dönüştürülmüş XML’i özelleştirilmiş bir şemaya karşı doğrulayın:

using System.Xml;
using System.Xml.Schema;

public class DicomXmlValidator
{
    private readonly XmlSchemaSet _schemaSet;
    private readonly List<string> _validationErrors;

    public DicomXmlValidator(string schemaPath)
    {
        _schemaSet = new XmlSchemaSet();
        _schemaSet.Add(null, schemaPath);
        _validationErrors = new List<string>();
    }

    public bool ValidateXml(string xml, out List<string> errors)
    {
        _validationErrors.Clear();
        
        var settings = new XmlReaderSettings
        {
            ValidationType = ValidationType.Schema,
            Schemas = _schemaSet
        };
        
        settings.ValidationEventHandler += (sender, e) =>
        {
            _validationErrors.Add($"{e.Severity}: {e.Message}");
        };

        try
        {
            using (var stringReader = new StringReader(xml))
            using (var xmlReader = XmlReader.Create(stringReader, settings))
            {
                while (xmlReader.Read()) { }
            }
        }
        catch (XmlException ex)
        {
            _validationErrors.Add($"XML Error: {ex.Message}");
        }

        errors = new List<string>(_validationErrors);
        return errors.Count == 0;
    }
}

En İyi Uygulamalar

Sağlık entegrasyonu için DICOM’u XML’e dönüştürürken:

  • Kodu tutun: Özellikle uluslararası hastaların isimleri için karakter kodlaması doğru şekilde işlenmesini sağlayın
  • İkili veri işleme: Büyük piksel verileri XML’e yerleştirmek yerine dışarıdan referans edilmelidir
  • Güvenilir çıkış: Önemli entegrasyon noktaları için XML şeması doğrulama kullanın
  • Düşünce performansı: Büyük arşivler için, akış serializasyonu ve paralel işleme kullanın
  • Doküman haritalama: DICOM haritayı XML yapısına nasıl etiketlediğinize dair net bir belge tutun

Sonuç

DICOM dosyalarını XML’e dönüştürmek, kurumsal sağlık sistemleri, HL7 mesajlaşma ve miras uygulamaları ile entegrasyonu sağlar. Aspose.Medical for .NET, yuvarlak dönüşüm desteği ile sağlam serializasyon yetenekleri sunar, biçim değişiklikleri üzerindeki veri bütünlüğünü garanti eder. Entegrasyon köprüleri inşa ediyorsanız, veri aktarmak ya da hastane bilgi sistemlerine bağlanmak, bu XML dönüşme teknikleri sağlık işbirliği için sağlam bir temel oluşturur.

DICOM XML serializasyonu hakkında daha fazla bilgi için lütfen Aspose.Tıbbi Belgeler.

More in this category